本作品的主線原本重視校園格鬥風格，講述主角凪宗一郎及牧原鮑伯入讀日本一所集合全國武術家子弟的統道學園，因而遇上的種種經歷。凪宗一郎邂逅了校園內的武術頂尖高手棗真夜及棗亞夜，並加入了她們的柔劍部，與敵對的學園執行部發生一連串的抗爭。誰知主角們平凡的校園角力中，原來蘊藏了一項規模遠超乎想像的大陰謀。凪宗一郎開始接觸到世界上各種「異能之士」，逐漸來到一個陌生的領域之中，更驚人的是他發現了原來自己亦是擁有異能之士。牽涉一場浩瀚百年之戰的命運，正在等待著凪宗一郎與身邊的人的腳步……