在極寒之地俄羅斯，謎之美女折原麻耶從賣主得到極危險病毒（生物武器）後，將病毒感染給賣主後前往日本，並在東京殺害了俄羅斯的特務，作為生物老師，來到主角高木藤丸就讀的彌代學院。 高木藤丸外表看起來是個普通的少年，但是暗地裡是個天才駭客「獵鷹」，現在幫助父親所屬的「THIRD-i」工作。 恐怖主義者折原麻耶的目的是病毒的感染爆發計畫「BLOODY MONDAY」、天才駭客「獵鷹」及治安維持組織「THIRD-i」的監視、以及「聖誕節屠殺」檔案回收。到底，獵鷹高木藤丸能否利用駭客技術拯救日本!?