引起異變的緬因貓獸在空間的扭曲中消失之後，泉光子郎拼命地尋找著應對感染數碼獸的對策。然而，高石岳卻發現自己的數碼獸搭檔巴達獸被感染的徵兆。期望安定之人——恆常性藉由八神光的身體，宣告了「重啟」這一解決數碼世界與現實世界危機的手段。然而，這伴隨著一個巨大的犧牲，即數碼獸將失去記憶。隨後，暴走的緬因貓獸出現在御台場。數碼獸們雖然團結一致全力以赴，然而感染卻進一步蔓延。唯一有幸未被感染的甲蟲獸與光子郎告別，進化為力神比多獸。力神比多獸將其他的夥伴以及緬因貓獸推回扭曲中的那一瞬間，數碼世界由於「重啟」被重新啟動，人類世界回歸日常。被選召的孩子們陷入失意的低谷，卻又決定去與數碼獸再次相見。他們藉助姬川的協助前往了數碼世界，擺在他們眼前的則是失去記憶回歸幼年期的搭檔數碼獸們。