ベストセラー作家・田中芳樹による大長編SF小説で過去にアニメ化もされた「銀河英雄伝説」を、Production I.Gが新たにアニメ化した「銀河英雄伝説 Die Neue These（ディ・ノイエ・テーゼ）」。2018年のファーストシーズン「邂逅」（第1～12話）、19年のセカンドシーズン「星乱」（13～24話）に続くサードシーズン「激突」全12話を3章に分けて上映する劇場上映版の第3章。帝国暦489年（宇宙暦798年）4月、ケンプ提督が率いる銀河帝国軍による、イゼルローン要塞への苛烈を極める攻撃が開始された。イゼルローン要塞駐留艦隊を率いる司令官ヤンは、政府から出頭を命じられた査問会に出席のため不在で、司令官代理を務めるキャゼルヌを中心に防衛戦が繰り広げられる。帝国軍急襲の報せは、ヤンのいる首都ハイネセンにも届くが……。